李姜

李姜 Jiang Li, Ph.D.

科研助理教授

细胞与基因技术研究院,深圳理工大学

个人简介

李姜博士,现任深圳理工大学细胞与基因技术研究院科研助理教授。2024年获香港城市大学生物医学系博士学位,博士期间赴美国City of Hope希望之城国家医疗中心访学。研究方向主要以人工智能与多组学大数据为核心技术框架,围绕癌症精准分型、非编码RNA调控机制及临床转化开展系统性研究,致力于开发面向肿瘤诊断与预后的生物信息学工具与跨癌种数据库。目前以第一作者或通讯作者(含共同)身份在 Nucleic Acids Research(2020, 2026)、iScience(2025)、Clinical & Experimental Allergy(2026)、International Immunopharmacology(2025)、Computational and Structural Biotechnology Journal(2022, 2024)、STAR Protocols(2025)等期刊发表SCI以及会议论文11篇,并且担任MedComm等杂志审稿人。

教育背景

  • 2020.9 – 2024.8

    博士,癌症生物信息

    生物医学系,香港城市大学,香港特别行政区

    导师: 王鑫 副教授(香港中文大学外科系)

    钱玥明 副教授(香港城市大学生物医学系)

  • 2022.7 – 2023.1

    访问学者,全球学者计划

    分子诊断和实验治疗学系,希望之城国家医疗中心,洛杉矶,美国

    导师:Ajay Goel 教授(首席教授,系主任)

  • 2017.9 – 2020.7

    硕士,生物信息

    信息学院,华中农业大学,武汉,中国

    导师:张红雨 教授

  • 2018.7 – 2018.8

    访问学生,暑期研讨会项目

    新加坡国立大学计算机学院,新加坡

  • 2013.9 – 2017.7

    学士,生物科学

    生命科学技术学院,华中农业大学,武汉,中国

工作经历

  • 2026.04 – 至今

    科研助理教授

    细胞与基因技术研究院

    深圳理工大学

  • 2024.11 – 2026.04

    助理研究员

    临床大数据研究中心

    中山大学附属第七医院(深圳)

论文成果

共同第一

Li J#, Hong X#, Chi M et al.

Circulating Piwi-interacting RNAs Associate with Childhood Asthma ICS Response with Vitamin D Effect Modification.

Clinical & Experimental Allergy, 2026

共同第一

Huang R#, Li J#, Cao Q#, Wang L#, Shao Z et al.

PCsRNAdb: a comprehensive resource of small noncoding RNAs across cancers.

Nucleic Acids Research, 2026; 54(D1): D1545–D1555

共同第一

Li J#, Yang C#, Zhang Y et al.

Deciphering aging-associated prognosis and heterogeneity in gastric cancer through a machine learning-driven approach.

iScience, 2025; 28: 112316

共同第一

Li J#, Yang C#, Zhang Y et al.

Leveraging miRNA-mediated expression profiles to predict prognosis and identify distinct molecular subtypes in ovarian cancer: a multi-cohort study.

International Immunopharmacology, 2025; 150: 114303

第一作者

Li J, Hong X, Zhu Z, Li J.

Protocol for tumor prognostic prediction, molecular stratification, and target discovery using a machine learning-driven approach.

STAR Protocols, 2025; 6(4): 104130

通讯作者

Zhu Z, Cao Q, Chen J, Sun Y, Liu F, Li J*, Tan M*.

Expression pattern of cancer-associated cellular senescence genes in clear cell renal cell carcinoma distinguishes tumor subclasses with clinical implications.

Scientific Reports, 2025; 15(1): 442

合作

Jiang M#, Zhang Y#, Liu T#, Hong X#, Kho AT, Li J, et al.

Circulating miRNAs and childhood asthma ICS response: a stratified analysis in the intervention arm of an RCT with vitamin D effect modification.

Thorax, 2025; 80(11): 788–795

第一作者

Li J, He L, Zhang X et al.

GCclassifier: An R package for the prediction of molecular subtypes of gastric cancer.

Computational and Structural Biotechnology Journal, 2024; 23: 752–758

第一作者

Li J, Song K, Li X et al.

Identification of subtype-specific master regulatory long non-coding RNAs of gastric cancer through a network-based approach.

2023 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), Istanbul, Turkiye. 2023; pp. 2777–2782

合作

Okuno K, Pratama MY, Li J, Tokunaga M, et al.

Ginseng mediates its anti-cancer activity by inhibiting the expression of DNMTs and reactivating methylation-silenced genes in colorectal cancer.

Carcinogenesis, 2023; 44: 394–403

第一作者

Li J, Wu T, Song K et al.

Integrative network analysis reveals subtype-specific long non-coding RNA regulatory mechanisms in head and neck squamous cell carcinoma.

Computational and Structural Biotechnology Journal, 2022; 21: 535–549

合作

Tian Y, Li J, Cheung TC et al.

Akt3 promotes cancer stemness in triple-negative breast cancer through YB1-Snail/Slug signaling axis.

Genes & Diseases, 2022; 10: 301–306

第一作者

Li J, Xue Y, Amin MT, et al.

ncRNA-eQTL: a database to systematically evaluate the effects of SNPs on non-coding RNA expression across cancer types.

Nucleic Acids Research, 2020; 48(D1): D956–D963

第一作者

Li J, Tong XY, Zhu LD, Zhang HY.

A Machine Learning Method for Drug Combination Prediction.

Frontiers in Genetics, 2020; 11: 1000

合作

Quan Y#, Luo ZH#, Yang QY#, Li J, et al.

Systems Chemical Genetics-Based Drug Discovery: Prioritizing Agents Targeting Multiple/Reliable Disease Associated Genes as Drug Candidates.

Frontiers in Genetics, 2019; 10: 474

专利 / 软件著作权

一种药物活性的预测方法及其应用

发明专利,ZL201710769899.7,专利权人(排名4/7),国家知识产权局

GCclassifier: 基于R语言的胃癌分子亚型预测平台

2026SR0082562,著作权人(排名1/3),国家版权局

COMPSRA: 基于Java的miRNA数据分析平台

2025SR2014194,著作权人(排名3/3),国家版权局

Deep-eccScan:基于深度学习的染色体外环状DNA检测软件

2025SR2477308,著作权人(排名3/3),国家版权局